補中益氣丸主治飲食勞倦、脾虛氣弱、內傷寒熱而引起的頭昏自汗、少氣懶言、久痢等癥。現代則廣泛用于虛證疾患，諸如營養不良、貧血等。近年臨床報道，該藥經中醫辨證后治療下列 疾病 也有良效。

　　老年氣虛感冒 取蘇葉3克，搗碎后用沸水浸泡，以該藥茶引送服補中益氣丸1丸，每日早、晚各1次。

　　白細胞減少癥 該藥配方中黨參、白術對于因化療或放療引起白細胞下降有促其回升之效。補中益氣丸每次2丸，每日3次，15天為1療程，連續 用藥 3～4個療程，直到血常規檢查正常為止。

　　脫肛 該藥能增強腸道平滑肌能力，治療脫肛及無力性疾病有效。治療時用補中益氣口服液(也可用丸劑)，每服1支，每日2～3次。一般用藥15～20天即可取得療效。

　　褥瘡 該配方中黃芪可提高免疫力，增強皮膚營養，促進創傷組織肉芽形成，制止化膿，擴張周圍血管，改善血液循環；當歸則有提高機體免疫力、解熱、鎮痛和鎮靜作用，有利于褥瘡恢復。補中益氣丸每次1丸，1日3次，2～3個月褥瘡可明顯縮小，可獲痊愈。

　　腸易激綜合征 用補中益氣丸，每日2次，每次1丸，15天為1個療程。

　　治眼瞼下垂 對于眼瞼下垂、上瞼不能上舉、眼難睜并疼痛的患者給予補中益氣丸，每日2次，每次1丸，一般服藥半月即見效。