目前有許多臨床醫師和藥店藥師均將桂附地黃丸當作金匱腎氣丸給患者使用。但桂附地黃丸不是金匱腎氣丸。
　　古方金匱腎氣丸的確可以叫做桂附地黃丸或者八味地黃丸，但是現在的金匱腎氣丸和古方濟生腎氣丸相近，多用于利尿治療下肢水腫。而如今的桂附地黃丸則與宋代的八味丸相近，主補腎陽。
　　首先，古方金匱腎氣丸處方已與今方（藥店銷售）金匱腎氣丸處方不同，按現今國家藥品標準，桂附地黃丸與金匱腎氣丸是處方組成不同的兩種中成藥，因此把藥店里的金匱腎氣丸當作桂附地黃丸銷售是錯誤的；其次，“今方金匱腎氣丸的方劑由熟地、山藥、山茱萸、茯苓、澤瀉、牡丹皮加桂枝、附子八味組成”的說法是錯誤的。同時，桂附地黃丸方中用的不是桂枝而是肉桂，山茱萸、附子也是炮制品；再次，六味地黃丸是由金匱腎氣丸減去肉桂、制附子兩味藥化裁而成，說金匱腎氣丸是在六味地黃丸的基礎上加入桂枝、附子兩味藥組成的，則是本末倒置。
　　古方金匱腎氣丸為醫圣張仲景（東漢）創制，載于《金匱要略》，在該書中有兩個名，即該書“中風歷節病脈證并治第五”篇中的“崔氏八味丸”和“婦人雜病脈證并治第二十二”篇中的“腎氣丸”。處方由干地黃、山茱萸、山藥、澤瀉、茯苓、牡丹皮、桂枝、附子（炮）八味藥組成，用于治療“腳氣上入，少腹不仁”及婦女“轉胞”。宋代陳師文等人奉敕所撰《太平惠民和劑局方》（成書于1110年）對該方進行了改進，將桂枝改為肉桂，干地黃改為熟地，且加大肉桂及制附子的用量，使該藥藥效有了質的提高，更主要用于腎氣虛乏，取名“八味丸”，收載于該書“卷之五·治諸虛（附骨蒸）”。由于該方最早出自《金匱要略》，且與六味地黃丸相比，多了肉桂、制附子兩味藥，所以后世又習稱其為金匱腎氣丸、桂附地黃丸、八味地黃丸。而六味地黃丸系宋代太醫錢乙針對小兒“腎無實，必主虛”的病理特點，去掉金匱腎氣丸中附子、肉桂兩味藥，創制而成，載于《小兒藥證直訣·卷下·諸方》（成書于1119年），原名“地黃丸”，用于兒科“治腎怯失音，囟開不合，神不足，目中白睛多，面色白”，即小兒腎虛。在歷代醫學典籍中，六味地黃丸應用極為廣泛，遍布內、外、婦、兒、五官、皮膚等各科雜癥，現主要用于腎陰虛證。而南宋醫家嚴用和在“金匱腎氣丸”基礎上加入川牛膝（去蘆，酒浸）、車前子（酒蒸），并將山藥炒用，加減化裁制成“加味腎氣丸”，并收載于其《嚴氏濟生方》（簡稱《濟生方》，成書于1253年）中，后世習稱之為濟生腎氣丸，治腎虛腰重，腳腫，小便不利。如果說六味地黃丸是對金匱腎氣丸的提煉，那么，濟生腎氣丸是對金匱腎氣丸的發展。